교수협은 이사회 직후 학교 홍보팀에서 작성한 자료가 언론에 배포되면서 이사회가 '총장의 손을 들어주었다', '총장을 재신임했다', '교수협의회는 총장 사퇴 촉구의 명분을 잃게 됐다'라는 표현이 언론에서 나온 것과는 달리 이사회 현장의 분위기는 그렇지 않았다는 점을 강조했다. 경종민 교수협의회장은 "이사회에서는 총장이 구성원들과 충분히 소통하지 못하고 이사회에서까지 학내 문제들이 불거져 나오게 하는 것에 대해 강한 불만을 제기한 것으로 알고 있다"며 "이는 여전히 구성원들과 소통하지 않고 있는 총장의 리더십 부족 때문이라고 오랜 시간 동안 강하게 질타했다"고 밝혔다. 그는 "서남표 총장은 평의회가 구성되자마자 기다렸다는 듯이, 평의회를 무력화하는 방향의 규정 변경을 밀어붙이고 있다"며 "자문기구가 된 평의회를 거들떠나 볼 것인지 구성원들은 모두 의구심을 가질 수밖에 없다"고 개탄했다.

교수협은 구성원의 지지를 받지 못하는 지도자는 어떠한 의미있는 역할도 할 수 없다고 강조한 뒤, 이제는 새 시대를 열어갈 사람에게 자리를 내어주고 자리를 물러나야 한다고 주장했다. 경 회장은 "우선은 평의회의 정상적인 가동과 이사회 구성 개선은 KAIST의 지속적 발전을 위해 매우 중요하다"며 "이를 통해 서 총장은 이미 이룩한 테뉴어 심사 강화와 거액의 기부금 확보 업적 외에 KAIST 역사상 처음으로 평의회와 이사회 구성 개선을 이루는데 기여한 총장으로 오래 기억될 것"이라고 조언했다. 한편 KAIST는 같은 날 교내에서 대학평의회 회의를 갖고 위원장에 강성호 화학과 교수를, 부위원장에는 김종득 생명화학공학과 교수를 선출했다고 밝혔다. KAIST에 따르면 이날 대학평의회 의원 25명이 참석한 가운데 제1회 대학평의회 회의가 열렸으며, 회의에서는 위원장 및 부위원장을 선출한 뒤 총장이 임명장을 수여했다. 강 위원장과 김 부위원장은 모두 총장이 지명한 보직 교수가 아닌, 전체교수회의에서 선출한 평의원들이다.

이들은 각각 동료 교수의 추천으로 단독 후보에 올랐으며, 특별한 반대 의사가 없으면 동의로 간주하는 방식으로 선임됐다. KAIST 관계자는 "위원장과 부위원장 모두 교수협의회에서 추천한 교수들이 당선된 만큼 교수협의회에서도 결과에 만족할 것"이라면서 "KAIST 구성원들의 입장을 대변하는 평의원들인 만큼 학교가 발전할 수 있는 방향으로 논의되길 바란다"고 말했다. KAIST는 총장이 임명하는 10명의 교원과 전체 교수회의에서 선임하는 15명의 교수 평의원으로 대학평의회를 발족했으며, 다음달 열리는 이사회에서 대학평의회의 명칭을 '교수평의회'로 바꾸는 한편 의결권을 배제하고 자문기구로 변경하는 등 개선안을 마련해 의결안건으로 상정할 계획이다. 다음은 교수협이 발송한 이메일 전문이다.